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高效的核酸标记是baseclick技术的核心。这是通过在核酸应用中使用优化的点击反应条件来实现的,我们围绕这一原理创建了完整的产品组合。
当在复杂的混合物中进行检测时,该技术的强度就变得至关重要,例如,用于检测细胞增殖。但是,与纯净和分离的化合物进行的反应也可以受益于出色的标记性能。
点击化学是Sharpless,Kolb和Finn在2001年提出的一个概念。1这个想法是通过一些非常好的反应将小的模块化化合物结合起来以产生化学多样性,而不是使用过多的反应来对每种化合物进行广泛的优化。转型。末端炔烃和叠氮化物之间的惠斯根环加成(CuAAC)的铜催化形式可以说是最受欢迎的点击反应之一。2,3该反应在许多官能团的存在下在水性溶剂(混合物)中以良好至极好的收率进行,基于发现该反应后的头十年,该反应已产生了1000多篇研究论文。4 除了反应的效率和模块化以外,CuAAC的其他一些特性也使它们优于许多其他点击反应。
所需的官能团可以通过相当简单的化学转化引入,它们具有良好的长期稳定性,并且具有相对较低的空间需求。后一特性是许多酶(例如聚合酶,糖基转移酶和许多其他酶)接受可点击的结构单元的主要原因之一。
反应条件对寡核苷酸的适应特别有益。5,6面对用一个以上标记密集标记寡核苷酸的挑战时,慕尼黑路德维希马克西米利安斯大学的科学家意识到点击化学可以做到这一点。为了将其付诸实践,他们制备了含有炔官能团的DNA构件以制备寡核苷酸,并为所需的标记物配备了叠氮化物。单击过程的效率和鲁棒性使许多科学家信服,他们开始要求发现者提供构建基块。
对于可点击的DNA构建基块不断增长的需求推动了2008年基本点击的建立。此后,我们和全球研究人员不断增加基于点击化学的应用的多样性。
细胞分裂对于所有生物都是至关重要的,因为它是生长和再生的基础。在真核生物中,例如人类,细胞分裂之前是DNA复制。复制自身DNA(即增殖)的能力是细胞的关键特性,因为它是众多细胞过程的指标,并且在癌症治疗和化合物的细胞毒性评估中得到了研究。
Baseclick开发了同类最佳的试剂盒系统来研究细胞增殖,该系统优于其他方法。该试剂盒基于惊人的原理:真核细胞吸收了胸苷的炔基修饰的核苷类似物5-乙炔基2'-脱氧尿苷(EdU)。在细胞内部,宿主酶产生人工核苷的三磷酸,然后通过DNA聚合酶将其掺入从头合成的DNA中。然后通过特异性点击荧光染料来检测得到的炔烃修饰的DNA。
抗体有助于我们的身体排斥病原体,并已成为针对诸如癌症等疾病的有价值的治疗方法。适体是具有类似于抗体的特异性结合活性的DNA或RNA寡核苷酸。由于适体较小,可在体外进化并可以通过合成方法制备,因此与来自哺乳动物细胞培养物生产的抗体相比,它们具有一些有趣的优势。例如,证明了当将适体用于细胞成像中时,与抗体相比,其具有更好的检测性能。7
世界各地的科学家和公司目前正在开发有效生产和测试适体的方法。与抗体相比,许多处理步骤可以自动化,从而节省了资源(包括动物模型)。由于DNA和RNA主要由四个结构单元组成,因此与蛋白质中的20(21)个氨基酸相比,所得聚合物的化学多样性降低了。这极大地限制了适体通常可以结合的靶的数量和性质。
所谓的click-SELEX程序的发明至少部分地克服了适体技术的瓶颈。在click-SELEX中,炔烃修饰的核苷酸用于PCR期间的酶促掺入,然后将所得的寡核苷酸与功能化的叠氮化物进行点击,以增加核酸的化学多样性。8因此,增加了找到良好目标结合剂的成功率,并且可以调节寡核苷酸的物理化学性质。
近年来,RNA治疗剂正朝着成为一类新型药物的方向发展,该类药物应能够对尚未治愈的疾病进行瞬时基因治疗。9 Alnylam公司第一个FDA批准的siRNA药物Patisiran是所有RNA治疗技术的重要基石。取得这一里程碑式成就的关键是将siRNA与N-乙酰半乳糖胺偶联以进行受体介导的摄取,从而实现寡核苷酸药物的靶向递送。由于siRNA分子的尺寸较小,因此可以通过化学合成进行生产,并且使药物化学方法可以优化引线结构。10
随着mRNA治疗药物的出现,与siRNA相比,它们面临着更大的挑战。由于它们的尺寸更大,因此化学制备不是一种选择,因此可通过从DNA模板进行体外转录来产生mRNA。到目前为止,所得mRNA的化学修饰主要限于转录过程中RNA聚合酶所接受的核苷酸。因此,mRNA的靶向递送要复杂得多,并且可以通过修饰转染剂而非mRNA来实现。
Baseclick目前正在寻求一项程序,以开发和建立化学修饰mRNA的方法。我们坚信,点击化学可以成为克服mRNA药物开发中剩余挑战的重要选择。
核酸测序技术发展迅速,被认为是诊断的关键技术,可能代表个性化医学的分析基础。尽管技术上取得了巨大的进步,但仍需要提高效率,产量和成本。这可以通过减少单个测序反应的大小和大规模的并行设置来实现。
今天,已经有一些方法可以对单个DNA分子进行实时测序。为了实现这一点,测序反应所需的试剂必须符合严格的规格。对于其中的某些试剂,这仅在使用单击化学时才可行,因为它结合了复杂混合物中的高收率和温和的反应条件,可用于简单地创建化学多样性。
此外,正在对点击化学进行研究,以改善样品制备,NGS应用的芯片或微阵列装载量。